בשלב השני של טיפול CBT, מזהים את דפוסי החשיבה האוטומטיים והשליליים שמחזקים חרדה לאורך זמן. פעמים רבות אדם מגיב למצב מסוים במהירות, בלי לעצור לבדוק האם המחשבה שעלתה באמת תואמת את המציאות. המחשבות האלה יוצרות תחושת איום, מגבירות לחץ ולעיתים גם מובילות להימנעות או חוסר ביטחון.





